Не встречала ни одной классификации пейрингов, которая бы мне понравилась. Потому что все нормальные люди хотят все пейринги всех фандомов распихать по коробочкам, а у меня маниакальное желание расчленить их на тысячу групп.
Если грубо, то я бы характеризовала бы:
- каждого персонажа (пол, возраст, внешность, ум (который бы в свою очередь разделила бы на интеллект и смекалку), мировоззрение (причём принадлежность той или иной стороне в каком-либо конфликте выделила бы отдельно. Потому что пример Банкорана и его предка отлично показывает, как у людей могут может совпадать мировоззрение, ум, темперамент, но при этом воевать эти люди будут по разные стороны баррикад), характер, опыт (жизненный опыт вообще, опыт взаимоотношений и отдельно - опыт "пейринговых" взаимоотношений), социальное положение (разделила бы на богатство, знатность и отдельным пунктом уважение (к роду и к положению. Последнее пояснять не надо, а насчёт первого мне вспоминается "Хоббит" и рассказ о том, почему Сумниксов почитают больше, нежели Туков))). При этом не стоит забывать, что при изменении системы отсчёта характеристики могут очень сильно меняться - так Книсаа (starwars.wikia.com/wiki/Kneesaa) в мире эвоков считается знатной красавицей, тогда как в Империи в целом её считают существом второго сорта.
- отношения персонажей (от обожествления, до случайного секса. От бешеного желания и бешеной страсти (для тех, кто не видит разницы - первое может быть и у тентакля, второе - никогда) до нежной привычки. Всех оттенков не перечислишь. И это только та часть отношений, которую принято называть любовью (я бы большую часть всего этого любовью называть не стала, но кого это волнует). А где это видано, чтоб никаких других чувств (от ненависти до уважения) в отношениях не было?), история взаимоотношений (я бы и историю взаимоотношений с родственниками и близкими добавила. А вместо того, чтобы смеяться, попробуйте рассказать историю взаимоотношений Номи и Улика, не упоминая Виму, а историю взаимоотношений Дюрана и Этранж, не упоминая Паталлиро. Не знакомы с произведениями о них? Тогда взаимоотношения Ивана Карамазова и Катерины Ивановны без упоминаний о брате, Мите Карамазове).
- отношение общества к взаимоотношениям персонажей.
И это только классификация пейрингов. А что делать с классификацией фанфиков в целом? Интерпретации в целом? Самая простая классификация, конечно, относительно канона и характеров: AU в рамках мира и обоснованный ООС (мир без привычных персонажей относится к этому же пункту), AU за рамками мира и обоснованный ООС, AU в рамках мира и ООС с потолка, AU за рамками мира и ООС с потолка (то есть, остались только имена), ООС с потолка в рамках канона (например missing scene, где Обоснуй не жил), обоснованный ООС в рамках канона (missing scene, где Обоснуй жил ^___^), отсутствие ООС в рамках канона (тоже missing scene и пересказ канона).* Но мы же не ищем лёгких путей! Да и потом, в этой классификации не учитывается ни настроение, ни идеи канона...

*Характеристика грубая. Возможны и missing scenes в рамках канона, но за гранью мира, однако сейчас не об этом.